Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL1Q9NR64 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL1Q9NR64 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL1Q9NR64 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms