Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GDF3Q9NR23 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GDF3Q9NR23 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GDF3Q9NR23 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms