Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRIP3Q9NQ35 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRIP3Q9NQ35 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms