Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms