Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARFGAP3Q9NP61 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFGAP3Q9NP61 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms