Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9N2J8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9N2J8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9N2J8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9N2J8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9N2J8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9N2J8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9N2J8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9N2J8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9N2J8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9N2J8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9N2J8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9N2J8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9N2J8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9N2J8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9N2J8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9N2J8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9N2J8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9N2J8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9N2J8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9N2J8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9N2J8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9N2J8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9N2J8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9N2J8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9N2J8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9N2J8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9N2J8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9N2J8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9N2J8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9N2J8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9N2J8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9N2J8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9N2J8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9N2J8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9N2J8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9N2J8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9N2J8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9N2J8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9N2J8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9N2J8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9N2J8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9N2J8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9N2J8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9N2J8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9N2J8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9N2J8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9N2J8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9N2J8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms