Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA4Q9HCM2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA4Q9HCM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNA4Q9HCM2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms