Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ2

PRDM16, PR domain zinc finger protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16Q9HAZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM16Q9HAZ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM16Q9HAZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM16Q9HAZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM16Q9HAZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM16Q9HAZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM16Q9HAZ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM16Q9HAZ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM16Q9HAZ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM16Q9HAZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM16Q9HAZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM16Q9HAZ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms