Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF408Q9H9D4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF408Q9H9D4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF408Q9H9D4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF408Q9H9D4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms