Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNCQ9H7C4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNCQ9H7C4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms