Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMYD3Q9H7B4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMYD3Q9H7B4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMYD3Q9H7B4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms