Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR55Q9H6Y2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR55Q9H6Y2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms