Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPAP3Q9H6T3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP3Q9H6T3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAP3Q9H6T3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms