Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
OPA3Q9H6K4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPA3Q9H6K4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms