Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD1Q9H4M9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHD1Q9H4M9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD1Q9H4M9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms