Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SENP3Q9H4L4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SENP3Q9H4L4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SENP3Q9H4L4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms