Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIBC2Q9H4K1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIBC2Q9H4K1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms