Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GANQ9H2C0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GANQ9H2C0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GANQ9H2C0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms