Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EHD4Q9H223 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EHD4Q9H223 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms