Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD1Q9GZZ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD1Q9GZZ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD1Q9GZZ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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