Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP1Q9GZU7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms