Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR2J2Q9GZM3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2J2Q9GZM3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms