Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL4Q9C0H6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL4Q9C0H6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL4Q9C0H6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms