Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZCCHC2Q9C0B9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms