Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPEF2Q9C093 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SPEF2Q9C093 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPEF2Q9C093 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPEF2Q9C093 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms