Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM31Q9BZY9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM31Q9BZY9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms