Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM54Q9BYV2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM54Q9BYV2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM54Q9BYV2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms