Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms