Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MXD3Q9BW11 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MXD3Q9BW11 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MXD3Q9BW11 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms