Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNPPD1Q9BV87 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPPD1Q9BV87 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPPD1Q9BV87 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms