Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAMP8Q9BV40 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms