Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDC1Q9BTX1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDC1Q9BTX1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms