Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP3Q9BQQ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms