Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BPIFA3Q9BQP9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BPIFA3Q9BQP9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms