Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA1CQ9BQE3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms