Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLX1AQ9BQ83 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLX1AQ9BQ83 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms