Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX50Q9BQ39 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX50Q9BQ39 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms