Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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KCNS3Q9BQ31 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNS3Q9BQ31 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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