Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF15Q99988 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDF15Q99988 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF15Q99988 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF15Q99988 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms