Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CITED1Q99966 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CITED1Q99966 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms