Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POP1Q99575 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POP1Q99575 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POP1Q99575 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POP1Q99575 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POP1Q99575 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POP1Q99575 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POP1Q99575 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POP1Q99575 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POP1Q99575 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POP1Q99575 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POP1Q99575 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POP1Q99575 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POP1Q99575 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POP1Q99575 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POP1Q99575 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POP1Q99575 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POP1Q99575 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POP1Q99575 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POP1Q99575 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POP1Q99575 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POP1Q99575 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POP1Q99575 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POP1Q99575 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POP1Q99575 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POP1Q99575 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POP1Q99575 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POP1Q99575 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POP1Q99575 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POP1Q99575 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POP1Q99575 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POP1Q99575 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POP1Q99575 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POP1Q99575 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POP1Q99575 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POP1Q99575 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POP1Q99575 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POP1Q99575 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POP1Q99575 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POP1Q99575 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POP1Q99575 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POP1Q99575 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POP1Q99575 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POP1Q99575 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POP1Q99575 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POP1Q99575 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POP1Q99575 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POP1Q99575 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POP1Q99575 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POP1Q99575 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POP1Q99575 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POP1Q99575 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POP1Q99575 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POP1Q99575 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POP1Q99575 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POP1Q99575 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POP1Q99575 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POP1Q99575 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POP1Q99575 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POP1Q99575 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POP1Q99575 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POP1Q99575 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POP1Q99575 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POP1Q99575 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POP1Q99575 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POP1Q99575 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POP1Q99575 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POP1Q99575 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POP1Q99575 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POP1Q99575 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms