Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LGMNQ99538 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LGMNQ99538 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms