Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORT1Q99523 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORT1Q99523 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORT1Q99523 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms