Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLCC1Q96S66 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLCC1Q96S66 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms