Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NODALQ96S42 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NODALQ96S42 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NODALQ96S42 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms