Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPS6KC1Q96S38 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KC1Q96S38 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms