Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

Predictions only

Length 5,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HMCN1Q96RW7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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