Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUNDC3BQ96NL0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUNDC3BQ96NL0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms