Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1Q96NA8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1Q96NA8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1Q96NA8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms