Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00167Q96N53 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00167Q96N53 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms