Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP4Q96MN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP4Q96MN2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP4Q96MN2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms